Здравствуйте. У контролеров имеется разные типы подключения: USAR, Wire, SPI, I2C, TWI. Какое подключение проще и удобнее использовать для обмена информацией между мастером и двумя слейвами ?(последовательный опрос каждого слейва.)

UART или SPI
- просто и не ресурсоемко.

_________________
Чтобы получить правильные ответы, надо задавать правильные вопросы!

В дополнение к сказанному Анатолием - Ваша задача упрощается тем, что мультипроцессорный режим UART аппаратно заложен в большинство микроконтроллеров AVR.
Поэтому ничего не нужно изобретать, просто нужно взять книгу и почитать про это (там ничего сложного, но на пальцах это долго рассказывать)

Вот поищите такое Микроконтроллеры AVR семейства Mega А.В.Евстифеев 2007

Нынешние среды программирования позволяют настраивать такие вещи в несколько галочек, поэтому если будет минимальное понимание - то все получиться.